合作医疗手机上交不了，是因为当地农村医疗没有开通手机上的缴费通道，比如没有微信公众号、手机APP等。不过，手机上交不了，可以带上本人有效身份证到当地医保办事处缴费，或者由当地村干部统一收取缴费。

具体能否在手机上交合作医疗费用，可以咨询当地的医保办事处，或者打客服电话了解。