公积金贷款扣款失败，在还款日当天还会再扣的。如果因为系统繁忙、还款银行卡余额不足而导致系统扣款失败，系统稍后会再次发起扣款申请。第一次扣款失败的话，用户一定要关注当天是否有第二次发起扣款，否则的话当天没有还款，就会算用户逾期。

用户也可以选择主动联系放款银行，选择主动还款，这样的话也会算用户正常还款。