支付宝自动还款和主动还款的区别在于，主动还款是用户在还款页面主动还款，还款时自己选择还款方式，至于自动扣款，则是系统按照支付顺序来扣款。主动还款与自动扣款都可以帮助用户按时还款，只要是按时还款，就不会影响到个人信用。

实际上，由于用户无法每期都确保自己能按时主动还款，因此自动还款的功能是很有必要的，自动还款可以避免用户忘记还款导致逾期。