微众银行的贷款还完了，征信中还留下了机构查询记录，是因为在还款过程中，微众银行会查询用户的征信进行贷后管理。贷后管理查询记录不会影响用户的征信，并且该记录只会保留2年，2年以后查询记录会自动删除。因此，微众银行只要是按时还款的，用户就不需要担心会影响到个人征信。

即使贷后管理查询记录过多，也不会影响用户后续办理其他信贷业务。