若是在还款日自动扣款，那么微粒贷会扣除借款银行卡中的钱；若是还款日自动扣款失败，那么一般是从还款日第二天中午开始，自动从微信零钱、零钱通、以及其他绑定储蓄卡中扣款。

因此，微粒贷会扣除零钱通的钱，但前提是还款日当天从银行卡中扣款失败、且微信钱包签约了“微粒贷自动还款”服务，微粒贷在还款日第二天24点前还款成功不影响征信和利息。

要查询有无签约“微粒贷自动还款”服务，操作路径是：打开微信-右下角【我】-【服务】-【钱包】-【支付设置】-【自动续费】，若有“微粒贷微信自动还款”服务则会扣除零钱通的钱。