办etc长期不用会有以下几个后果：

1、如果办理etc以后没有安装激活，那么押金不会退；

2、如果办理etc安装激活后长期不使用，且etc绑定的卡是信用卡，那么会产生年费，而如果没有缴纳年费导致信用卡逾期的话，那么逾期记录将会被上报给征信系统，这对于以后的贷款会有不小的影响；

3、如果etc绑定的是信用卡，且没有关闭小额免密支付，那么有可能会出现被盗刷的风险。

建议车主办理etc以后，如果不想再使用etc业务了，那么可以申请注销。

目前，车主可以携带行驶证、驾驶证、etc绑定的银行卡、etc通行卡和身份证到相应的银行或者etc管理部门申请注销。