申请公积金组合贷款后，若办理公积金月冲还贷业务，那么可以冲抵公积金贷款部分，也可以冲抵商贷部分。但会遵循公积金优先原则，即公积金余额要先用来冲抵组合贷款中的公积金贷款部分，然后再冲抵商贷部分。

公积金月冲还贷的扣款顺序是：先从借款人公积金余额中扣；不够再从借款人配偶的公积金余额中扣；若夫妻二人的公积金余额均不足，则会从绑定的还款银行卡中扣款；若银行卡余额也不足，则当月冲还贷失败，按逾期处理。