不是，基金手续费是根据成交金额来计算的，和留底仓没有关系，基金留底仓是为了防止踏空，若基金后续上涨，留有底仓就能获取更高收益，也可以为后续行情做准备，留有底仓，就会关注基金走势，在合适的位置，投资者又可以重新对基金进行投资。

基金手续费包括：申购费、赎回费和运作费（管理费、托管费和销售服务费），基金申购费根据成交金额而不同，成交金额越大，收费标准越低，基金赎回费根据持有时间而不同，持有时间越长手续费越低，甚至为0，基金运作费每日在基金资产中计提，每月进行支付，不单独向投资者收取。