农商银行申请的房贷扣款一般会在还款日当天的24点前扣款成功，具体几点需以银行规定为准，因为各地农商银行并不是一体的，各自银行的结算系统都是独立的。

房贷借款人不想产生逾期，最好在房贷还款日前1-3天将足额的资金存入还款银行卡账户。如果不小心错过了房贷还款日，借款人一定要第一时间联系农商银行，协商第二次扣款事宜。