花呗自动还款功能会按照扣款顺序进行扣款，余额宝也是扣款渠道的一种，用户将钱存入余额宝，不仅可以获得一定的收益，而且可以确保自己以按时还款。另外，用户可以自己设置扣款顺序，将余额宝设置为第一顺位，那么系统自动扣款就会从余额宝开始扣款。

而没有设置过扣款顺序，系统依次会从余额＞借记卡快捷＞余额宝该顺序进行自动扣款。