首套房贷款还清，再买算二套房。首套房的认定是认房又认贷，而认房又认贷是说以前有过房贷或买过房，以前买房是贷款买的，那么只要有以上情况，再买房都算是二套房。而且上一套房不管是全款买的，还是贷款买的，亦或者贷款不管有没有结清，再买房都算二套房。

二套房的贷款利率比首套房贷款利率高，因此二套房的购房成本会有所增加。