第一套公积金第二套商贷是算2套房的。二套房的认定是认房又认贷，即第一套房不管是全款还是贷款买，购买第二套申请贷款，就会按照二套房的标准来执行贷款利率与首付比例。二套房的贷款利率、首付比例均要高于第一套房，因此二套房是否要贷款买，用户需要自己想清楚。

至于第一套是公积金贷款，第二套房申请商贷，商贷的利率不管是采用固定利率，亦或者是LPR利率，都是会在定价基准上上浮的。