商贷一年后转公积金的办理流程如下：用户携带身份证、银行流水、购房合同等资料提交商贷转公积金贷款的申请，然后银行会对用户进行初审，初审通过以后用户要办理担保手续，凭担保公司出具的《阶段性担保函》与银行重新签贷款合同，之后补足原商贷余额与转贷的差额部分。

最后一步，就是管理中心发放贷款资金，这时候用户需要结清商贷，并且重新办理抵押手续。