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支付宝备用金逾期二十天是有影响的。备用金逾期20天，首先会影响到用户的芝麻信用，造成芝麻信用分降低。其次就是影响到备用金的后续使用，用户即使结清了欠款，可能也不能使用备用金了。最后，备用金逾期，还有可能会影响到借呗与花呗。

由于同是支付宝旗下的贷款产品，任何一个逾期，都有可能对其它两个产生影响。