购买航班延误险后，如果遇到航班取消的情况，保险公司会理赔。投保人需要保留好乘机凭证，并向机场或航空公司索取盖章的航班更改或取消证明，在相关保险规定期限内向保险公司提出理赔申请，以免被耽误。如果是因为恶劣天气导致整个机场关闭的，则属于除外责任，保险公司将不负责赔偿。

如果是航班延误4小时以上，而且没有上飞机，也可以申请理赔的，如果是航空公司因自身原因造成的延误，可根据航空公司的约定，申请航空公司与保险公司的双重赔偿。