用户申请汽车抵押贷款，绿本不一定会抵押给贷款机构。有的贷款机构只要进行登记就可以了，绿本可以由用户自己保存，因此就会出现贷款买车但是绿本在自己这里的情况。另外，如果是直接将车抵押给了贷款机构，那么也没有必要再抵押绿本了。

需要注意的是，绿本上登记了抵押，还清贷款以后一定要解除抵押，不然用户就没有车辆的所有权。