备用金和花呗是支付宝两种不同的消费信用贷款产品，是各自独立存在互不影响的，没有直接的关系。但是备用金和花呗都是由系统不定期地进行综合评估，并且都要参考芝麻信用分，以及账户使用情况，用户资信条件等。

不管是花呗还是备用金，要是使用后没有按时还款，逾期一旦影响芝麻信用分，导致综合评分降低，则另一方可能会被支付宝限制使用。