不可抗辩条款过两年后保险公司要不要赔钱，要看实际情况。不可抗辩条款的意思主要是说，若投保人或被保险人未如实告知相关事项，自含合同成立之日起超过两年的，保险人也不得解除合同，发生保险事故后保险人应当承担赔偿责任。但是，若保险人能证明被保险人有故意骗保行为，可拒绝理赔。

此外，以重疾险为例，若被保险人两年后罹患疾病为隐瞒疾病或相关疾病，保险人可拒绝理赔，若被保险人两年后罹患疾病并非隐瞒疾病且与其无关，则保险人应当理赔。