做市商制度和撮合交易制度的区别如下：

1、价格形成方式不同:撮合交易制度所有投资者买卖指令都汇集到交易所的主机中，电脑自动让价格相同的买卖单成交，开盘价是在9点25分时同时满足以下三个条件的基准价格，首先是成交量最大，其次是高于基准价格的买入申报和低于基准价格的卖出申报全部成交，而做市商制度开盘价格和随后的交易价格是由做市商报出的，成交价格是从交易系统外部输入的。

2、交易成本不同：撮合交易制度下，证券价格是单一的，投资者的交易成本仅仅是付给经纪人的手续费，而做市商提供“即时***”所索取的合理报酬，投资者被迫担负了额外的交易成本：价差。