夫妻双方可以约定选择一方进行扣除，这时候一方按照标准扣除100%，也就是扣除1000定额，选择后一个纳税年度不能变更。而夫妻双方在婚前各自贷款购买了首套住房，那么可以在婚后选择其中一套住房，由购买方按照标准扣除100%，或者夫妻双方对各自购买的住房按标准扣除50%。

因此，住房贷款利息专项附加扣除比例，主要是由夫妻双方来进行约定扣除。