钱还清了欠条没拿回来，用户可以要求对方交还欠条，或者用户自己保留还款的证据，这样可以避免后续产生纠纷。用户已经还清了欠款，如果出借方后续通过借条来起诉用户，用户也可以通过银行转账记录、和出借方之间的聊天记录来进行反驳。

因此，钱还清了但是欠条没有拿回来，对于用户不会产生太大的负面影响，特别是熟人之间借钱，后续再拿回欠条即可。