办理住房贷款利息个人所得税专项附加扣除，申请提交后当地税务机关会进行审核，大约可以在两三个星期内完成审批；然后会交由国库处理，大概要花一两周左右，处理完成就会马上把退税款项划转至纳税人的银行卡。整个流程下来，差不多是近一个月的时间。

对此，纳税人耐心等待就好。如果想了解具体进度，也可以打电话向当地税务机关的客服人员进行询问。