1、交易场所不同：沪市配股交易场所为上海交易所；而深市配股交易场所为深证交易所。

2、沪市和深市配股代码不同：沪市配股代码以70开头，转配股代码以71开头；深市配股代码以8开头，转配股代码以3开头。

3、配股流程不同：沪市为向证券交易所申报卖出配股（实质是买入），而深市为向证券交易所申报买入配股。T日是股权登记日，T1-T5为认购期，T1-T6为停牌期，T7恢复交易。