夫妻双方公积金不可以分别贷款。因为公积金贷款是以家庭为单位的，一个主贷一个参贷，在公积金贷款申请审批时，贷款发放是以夫妻双方收入作为还款能力测定的依据，所以夫妻双方有任意一方使用公积金贷款的情况下，如未还清另一方是不能够再办理公积金贷款的，否则会影响到家庭还款能力。

当然在夫妻公积金贷款额度足够高的情况下，在额度之内也可以以夫妻名义申请公积金二次贷款，具体以公积金审批为准。