4s店抵押车辆登记证是抵押给贷款机构。如果用户申请的是信用卡分期购车，则车辆登记证抵押给银行。而申请的汽车金融贷款，则用户需要将车辆登记证抵押给汽车金融公司。由于部分4S店是汽车金融公司也就是厂家直接提供贷款服务，因此有时车辆登记证会由4S店来保管。

对于用户来说，不管车辆登记证抵押在哪里，还清车贷以后都需要拿回车辆登记证并且解除抵押。