房贷第二天补扣算逾期。房贷是没有还款宽限期的，只要是还款日当天款项没有全额到账就会算逾期。如果用户在还款日当天发现扣款失败，千万不要坐等银行第二天自动扣款，必须及时主动联系银行工作人员提供还款账号，进行手动还款，好避免逾期发生。
如果是在第二天才将款项补进去，一定要主动打电话给银行说明情况，并开具非恶意逾期证明，这样可以降低逾期带来的影响。