公积金贷款不是直接扣除公积金。用户在申请公积金贷款时，公积金账户内的余额不会被扣除，贷款发下来的资金是住房公积金账户内他人未使用的公积金。而用户则可以办理公积金对冲业务，即使用公积金账户内的余额来归还公积金贷款。

公积金贷款需要连续缴纳公积金才可以申请，中途如果断交，并且没有在规定的时间内完成补缴，则公积金连续缴纳时间将重新计算。