贷款协商本金有可能会减免。用户的贷款逾期后，申请协商减免贷款本金，只要通过了贷款机构的审核，那么就有一定的几率协商成功。实际上，协商一般是分期还款、减免利息与罚息，申请减免贷款本金，成功率本身就是偏低的。

当然，贷款机构是否同意减免贷款本金，主要以最终的答复为准。用户情况特殊，但是态度良好，不排除贷款机构愿意减免贷款本金。