建议用户第一套房申请商贷，第二天房申请公积金贷款，这是因为第一套房商业贷款的房贷利率上浮的比例并不高，第二套房申请公积金贷款，则可以让房贷利率直接执行公积金基准利率的1.1倍。这样买两套房，用户支付的房贷利率是最少的。

而第一套房申请公积金贷款，第二套房在上一套房没有还清时，只能申请商业贷款，商业贷款二套房的房贷利率上浮的比例是较高的。