买房是否扣公积金余额，要根据房贷类型，分情况讨论：

1、商业贷款

商业贷款买房和公积金账户不挂勾，每个月还款的钱是从提供的还款卡里扣除。

即便这张还款卡是公积金卡，但是分为储蓄账户、公积金账户，则扣钱的话也只是扣储蓄卡账户的钱，不会扣公积金账户余额进行还款。

不过借款人可以在住房公积金中心办理还贷提前业务，把公积金余额转到银行卡里，用这个钱来偿还商业贷款，每年只能提取一次，不能超过上一年还贷总金额。

2、公积金贷款

公积金贷款虽然和公积金账户挂钩，但也不会直接扣公积金的余额还款。

需要在申请贷款时选择公积金对冲还款方式，或者是在贷款发放后还贷1个月后签订对冲还贷协议，才会扣公积金余额还款。